Взгляды Александра Спирина на рибосому как тепловой храповик

Финансирование

Эта работа была поддержана грантом № 1R35 GM139453 Национального Института Здоровья, предоставленного Иоахиму Франку.

Конфликт интересов

Автор заявляет об отсутствии конфликта интересов.

Соблюдение этических норм

Настоящая статья не содержит описания каких-либо исследований с участием людей или животных в качестве объектов.

Список литературы

1. Spirin, A. S. (1968) On the ribosome working mechanism: Hypothesis of locking-unlocking of subunits [In Russian], Dokl. Akad. Nauk. SSSR, 179, 1467-1470.

2. Spirin, A. S. (1968) How does the ribosome work? A hypothesis based on the two subunit construction of the ribosome, Curr. Mod. Biol., 2, 115-127, doi: 10.1016/0303-2647(68)90017-8.

3. Bretscher, M. S. (1968) Translocation in protein synthesis: a hybrid structure model, Nature, 218, 675-677, doi: 10.1038/218675a0.

4. Horan, L. H., and Noller, H. F. (2007) Intersubunit movement is required for ribosomal translocation, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 104, 4881-4885, doi: 10.1073/pnas.0700762104.

5. Frank, J. (1975) Averaging of low exposure electron micrographs of non-periodic objects, Ultramicroscopy, 1, 159-162, doi: 10.1016/s0304-3991(75)80020-9.

6. Frank, J., and Agrawal, R. K. (2000) A ratchet-like intersubunit reorganization of the ribosome during translocation, Nature, 406, 318-322, doi: 10.1038/35018597.

7. Moazed, D., and Noller, H. (1989) Intermediate states in the movement of transfer RNA in the ribosome, Nature, 342, 142-148, doi: 10.1038/342142a0.

8. Spirin, A. (2002) Ribosome as a molecular machine, FEBS Lett., 514, 2-10, doi: 10.1016/s0014-5793(02)02309-8.

9. Gavrilova, L. P., and Spirin, A. (1971) Stimulation of “non-enzymic” translocation in ribosomes by p-chloro-mercuribenzoate, FEBS Lett., 17, 324-326, doi: 10.1016/0014-5793(71)80177-1.

10. Ermolenko, D. N., Majumdar, Z. K., Hickerson, R. P., Spiegel, P. C., Clegg, R. M., and Noller, H. F. (2007) Observation of intersubunit movement of the ribosome in solution using FRET, J. Mol. Biol., 370, 530-540, doi: 10.1016/j.jmb.2007.04.042.

11. Fei, J., Kosuri, P., MacDougall, D. D., and Gonzalez, Jr., R. L. (2008) Coupling of ribosomal L1 stalk and tRNA dynamics during translation elongation, Mol. Cell, 30, 348-359, doi: 10.1016/j.molcel.2008.03.012.

12. Cornish, P. V., Ermolenko, D. N., Noller, H. F., and Ha, T. (2008) Spontaneous intersubunit rotation in single ribosomes, Mol. Cell, 30, 578-588, doi: 10.1016/j.molcel.2008.05.004.

13. Agirrezabala, X., Liao, H., Schreiner, E., Fu, J., Ortiz-Meoz, R. F., et al. (2012) Structural characterization of mRNA-tRNA translocation intermediates, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 109, 6094-6099, doi: 10.1073/pnas.1201288109.

14. Spirin, A. S. (2009) The ribosome as a conveying thermal ratchet machine, J. Biol. Chem., 284, 21103-21119, doi: 10.1074/jbc.X109.001552.

15. Spirin, A. S., and Finkelstein, A. V. (2011) The ribosome as a Brownian ratchet machine, in Molecular Machines in Biology (Frank, J., ed.) Cambridge Univ. Press, Cambridge, pp. 158-190, doi: 10.1017/CBO9781139003704.011.

16. Frank, J. (2017) The translation elongation cycle-capturing multiple states by cryo-electron microscopy, Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci., 372, 20160180, doi: 10.1098/rstb.2016.0180.