БИОХИМИЯ, 2018, том 83, вып. 5, с. 735–748
УДК 577.322
Рекомбинантная продукция, реконструкция в липид-белковые нанодиски и электронная микроскопия полноразмерной α-субъединицы калиевого канала Kv7.1 человека
1 Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997 Москва, Россия; электронная почта: zakhar-shenkarev@yandex.ru
2 Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, биологический факультет, 119234 Москва, Россия; электронная почта: sokolova@mail.bio.msu.ru
Поступила в редакцию 07.09.2017
После доработки 28.11.2017
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: ионный канал Kv7.1, Pichia pastoris, липид-белковые нанодиски, электронная мик- роскопия макромолекул.
Аннотация
Потенциалозависимый калиевый канал Kv7.1 играет важную роль в возбудимости клеток сердечной мышцы. Основным структурным элементом этого канала является α-субъединица KCNQ1. При тетрамеризации KCNQ1 в мембране формируется ионный канал, включающий пору и четыре потенциалочувствительных домена. Мутации в гене KCNQ1 человека являются одной из основных причин наследственной аритмии – синдрома удлиненного интервала QT. В представленной работе получена синтетическая конструкция, кодирующая полноразмерный белок KCNQ1 человека, и разработана система его экспрессии в клетках дрожжей Pichia pastoris. Мембранную фракцию клеток дрожжей, содержавшую рекомбинантный белок (rKCNQ1), солюбилизировали с помощью детергента CHAPS. Для моделирования липидного окружения канала, близкого к природному, из солюбилизированной мембранной фракции получали липид-белковые нанодиски на основе белка MSP2N2. Нанодиски, содержавшие целевой белок, отделяли с помощью очистки на аффинной смоле, используя последовательность rho1D4, представленную на С-конце rKCNQ1. Схожим образом была проведена очистка препарата rKCNQ1, солюбилизированного в CHAPS. Полученные препараты изучали с помощью просвечивающей электронной микроскопии с негативным контрастированием. Анализ микрофотографий показал, что оба использованных подхода позволили получить гомогенные препараты rKCNQ1. Статистический анализ изображений индивидуальных частиц белка, солюбилизированного в детергенте, показал наличие тетрамерной структуры, свойственной природному каналу. Реконструированная с разрешением 2,5 нм трехмерная структура канала представляет собой компактную плотность с диаметром мембранной части ~9 нм и высотой ~11 нм. Анализ изображений Kv7.1 в нанодисках выявил наличие дополнительного пояса электронной плотности, соответствующего фрагменту липидного бислоя и белку MSP2N2. Полученные данные показывают, что нанодиски могут быть успешно использованы для выделения, очистки, стабилизации в растворе и дальнейших структурных исследований канала Kv7.1 человека.
Текст статьи
Сноски
* Адресат для корреспонденции.