БИОХИМИЯ, 2018, том 83, вып. 4, с. 543–553
УДК 575.16
Оценка функциональной значимости хромосомных перестроек с позиции трехмерной архитектуры генома: практические рекомендации для врачей-генетиков
Обзор
1 Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН (ИЦиГ СО РАН), 630090 Новосибирск, Россия; электронная почта: minja-f@ya.ru
2 Новосибирский государственный университет, 630090 Новосибирск, Россия
Поступила в редакцию 15.11.2017
После доработки 04.12.2017
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: хромосомные перестройки, трехмерная архитектура ядра, 3С, Hi-C, генетика человека.
Аннотация
Клиническая цитогенетика за последнее десятилетие получила существенное развитие за счет увеличения скорости, количества и разрешения анализа хромосомных перестроек. Повсеместное внедрение в практику новых молекулярных методов, таких как сравнительная геномная гибридизация, полногеномное и полноэзомное секвенирование поставило перед исследователями проблемы в интерпретации огромного массива сгенерированных при обследовании данных. При этом большинство хромосомных перестроек у пациентов интерпретируются только как нарушения линейной последовательности нуклеотидов, игнорируя накопившуюся за последнее десятилетие информацию о значении организации хроматина в пространстве. В обзоре представлены основные достижения в исследовании пространственной укладки ДНК и роли трехмерной архитектуры в нормальном и патологическом развитии. Сформулированы практические рекомендации, которые помогают оценить последствия хромосомных перестроек с позиции нарушений в укладке ДНК. Самостоятельный раздел посвящен перечислению и описанию доступных ресурсов, с помощью которых врач-генетик может проанализировать последствия хромосомной перестройки.
Текст статьи
Сноски
* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.