БИОХИМИЯ, 2017, том 82, вып. 11, с. 1557–1576
УДК 577.21;577.2.08
Современные методы выявления модифицированных нуклеотидов в РНК
Обзор
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: посттранскрипционные модификации РНК, химические модификации нуклеотидов, минорные нуклеотиды, редактирование РНК, обратная транскрипция, масс-спектрометрия, полногеномное высокопроизводительное секвенирование.
Аннотация
Обзор посвящен подходам к выявлению модифицированных мономеров в составе РНК клеток живых организмов. В последние годы получены данные о динамическом изменении пула модификаций ключевых форм РНК в зависимости от внешних факторов, действующих на отдельные клетки, и физиологического состояния организма в целом. В недавних работах представлены экспериментальные доказательства взаимосвязи механизмов образования модифицированных/минорных нуклеотидов РНК в клетках млекопитающих с развитием патологических состояний. Разработка новых методов детекции химических модификаций нуклеотидов РНК клеток живых организмов и накопление знаний о вкладе модифицированных мономеров в метаболизм и функционирование отдельных форм РНК закладывают основы для создания новых диагностических и терапевтических подходов. Обзор содержит краткое описание рутинных методов определения модифицированных нуклеотидов РНК и подробное рассмотрение современных подходов, позволяющих не только выявлять, но и проводить количественную оценку глубины модификации отдельных нуклеотидов в индивидуальных формах РНК.