БИОХИМИЯ, 2017, том 82, вып. 4, с. 655–663
УДК 577.114.5;577.21;579.841
Структура и генный кластер капсульного полисахарида К93 Acinetobacter baumannii B11911, содержащего 5-N-ацетил-7-N-[(R)-3-гидроксибутаноил]псевдаминовую кислоту
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: Acinetobacter baumannii, структура капсульного полисахарида, локус биосинтеза капсулы, псевдаминовая кислота, гликозилтрансфераза.
Аннотация
Капсульный полисахарид (КПС), отнесенный к типу К93, выделен из бактерии Acinetobacter baumannii B11911 и изучен с помощью моносахаридного анализа наряду с одномерной и двумерной 1H- и 13C ЯМР-спектроскопией. Найдено, что КПС содержит производное псевдаминовой кислоты (Pse) и установлена структура разветвленного тетрасахаридного повторяющегося звена. Гены, входящие в локус биосинтеза капсулы KL93, были аннотированы и соответствовали установленной структуре КПС. Полисахарид K93 имеет общий трисахаридный фрагмент α-D-Galp-(1→6)-β-D-Galp-(1→3)-D-GalpNAc с КПС K14 A. nosocomialis LUH 5541 и A. baumannii D46. Кроме того, он имеет общий дисахаридный фрагмент β-D-Galp-(1→3)-D-GalpNAc и соответствующую предсказанную Gal-трансферазу Gtr5, а также инициирующую GalNAc-1-P-трансферазу ItrA2 с рядом других штаммов A. baumannii.