БИОХИМИЯ, 2017, том 82, вып. 2, с. 345–357
УДК 575.224.22: 577.214.5: 616-092.9: 616.12-008.331.1
Однонуклеотидные полиморфизмы, специфичные для гипертензивных крыс линии НИСАГ
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: гипертония, полиморфизмы, RNA-Seq, линия крыс НИСАГ.
Аннотация
Полиморфизмы в кодирующих и регуляторных областях генов могут оказывать модифицирующее влияние на процессы транскрипции и трансляции, изменять функцию белков, приводить к развитию заболеваний. В настоящей работе методом RNA-Seq проведен поиск полиморфизмов, специфических для крыс линии НИСАГ с наследуемой индуцируемой стрессом артериальной гипертензией. Сравнение найденных полиморфизмов с данными секвенирования геномов других 42-х линий и сублиний крыс, имеющихся в базах данных, 11 из которых известны как гипертензивные, показало значительные отличия генотипа крыс НИСАГ от генотипов всех проанализированных линий и сублиний крыс. Работа позволила выявить 1849 полиморфизмов специфических для крыс линии НИСАГ, а также 158 полиморфизмов, встречающихся только у гипертензивных линий крыс. Определены полиморфизмы с возможным негативным влиянием на функцию белка, в том числе, в генах, ассоциированных с гипертонией. Эти полиморфизмы могут рассматриваться как новые молекулярные мишени для дальнейшего изучения с целью их потенциального использования в терапии стресс-зависимой формы гипертонической болезни.