БИОХИМИЯ, 2016, том 81, вып. 12, с. 1838–1848
УДК 577.212.3
Структурные особенности белков оболочки потексвирусов, выявляемые оптическими методами
1 Московский государственный универститет им. М.В. Ломоносова, НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского, 119991 Москва, Россия; электронная почта: makarovvalentine@gmail.com, kalinina@genebee.msu.ru
2 Московский государственный универститет им. М.В. Ломоносова, биологический факультет, 119991 Москва, Россия; электронная почта: okar@genebee.msu.ru
Поступила в редакцию 23.05.2016
После доработки 14.07.2016
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: спиральные вирусы растений, потексвирусы, вирион, белок оболочки, структура, оптические методы.
Аннотация
В последнее время методом рентгеноструктурного анализа удалось показать, что основная (коровая) часть белков оболочки (БО) трех потексвирусов, гибких спиральных РНК-содержащих вирусов растений, обладает сходной альфа-спиральной структурой. Однако эти данные не позволяют объяснить структурную лабильность вирионов потексвирусов, которая, как полагают, определяет их биологические активности. В настоящей статье методом спектроскопии кругового дихроизма (КД) в дальнем ультрафиолетовом диапазоне проведено сравнительное изучение оптических свойств БО трех представителей рода Potexvirus c одинаковой морфологией и сходной структурой вирионов, как в составе вирионов, так и в свободном состоянии – вируса мозаики альтернантеры (ВМАльт), вируса аукуба мозаики картофеля (ВАМК) и Х-вируса картофеля (ХВК). Показано, что спектр КД вирионов ВМАльт аналогичен ранее полученному спектру КД вируса мозаики папайи (ВМПап), но заметно отличается от спектра вирионов ВАМК, сходного своими основными характеристиками со спектром КД Х-вируса картофеля (ХВК), который имеет аномально низкую для альфа-спиральных белков молярную эллиптичность. Проведенное гомологичное моделирование структуры БО в составе вирионов ВМАльт, ВАМК и ХВК на основе известных структур высокого разрешения для вирионов и вирусоподобных частиц потексвирусов ВМПап и вируса мозаики бамбука подтвердило, что структура коровой части БО для всех трех вирусов практически идентична. Вместе с тем сравнение аминокислотных последовательностей БО различных потексвирусов и предсказание неструктурированных участков в их составе указывает на вероятную корреляцию специфических особенностей в спектрах КД вирионов с наличием в составе БО N-концевых неупорядоченных участков.