БИОХИМИЯ, 2016, том 81, вып. 10, с. 1439–1450
УДК 577,182,62: 577,217,347:543,4
Новые флуоресцентные производные макролидов для изучения взаимодействия антибиотиков и их аналогов с рибосомным туннелем
1 Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, химический факультет, 119991 Москва, Россия; электронная почта: sumbtyan@belozersky.msu.ru
2 НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского, Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, химический факультет, 119991 Москва, Россия
3 Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова, Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт», 188300 Гатчина, Ленинградская обл., Россия
4 Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, 195251 Санкт-Петербург, Россия
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: макролиды, тилозин, флуоресцентные производные, рибосомный туннель, поляризация флуоресценции.
Аннотация
Осуществлен синтез ряда новых флуоресцентных производных макролидных антибиотиков группы тилозина, содержащих в качестве флуоресцентных групп остатки родамина, флуоресцеина, Alexa Fluor 488, BODIPY FL и нитробензоксадиазола (NBD). Комплексообразование полученных соединений с 70S рибосомами E. coli изучено с помощью измерения поляризации флуоресценции в зависимости от концентрации рибосом при постоянной концентрации флуоресцентного соединения. С использованием синтезированных флуоресцентных производных тилозина определены константы диссоциации ряда комплексов рибосом с известными антибиотиками, а также ранее полученными производными макролидов. Показано, что флуоресцентные производные тилозина, содержащие BODIPY FL и NBD группы, могут быть использованы для скрининга связывания новых производных антибиотиков с бактериальными рибосомами в области сайта связывания макролидов.