БИОХИМИЯ, 2016, том 81, вып. 3, с. 350–360
УДК 577.24
Взаимодействие фактора эксцизионной репарации нуклеотидов XPC–RAD23B с ДНК, содержащей кластерное повреждение – производное бенз[а]пирена и апуриновый/апиримидиновый сайт
1 Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090 Новосибирск; факс: +(383)333-3677, электронная почта: nadyarec@niboch.nsc.ru
2 Новосибирский государственный университет, 630090 Новосибирск
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: факторы эксцизионной репарации нуклеотидов, производные бенз[а]пирена, апуриновые/апиримидиновые сайты, кластерные повреждения ДНК, аффинная модификация, ДНК-белковые комплексы.
Аннотация
В результате комбинированного действия реакционноспособных метаболитов бенз[а]пирена (B[a]P) и окислительного стресса в ДНК могут возникать кластерные повреждения, содержащие одновременно объемные химические аддукты и апуриновые/апиримидиновые сайты (АР-сайты), исправляемые по механизму эксцизионной репарации нуклеотидов (ЭРН) и оснований (ЭРО) соответственно. Исследовано взаимодействие XPC–RAD23B – фактора, осуществляющего первичное узнавание повреждения в процессе ЭРН – с ДНК-дуплексами, содержащими в центральном положении одной цепи остаток производного B[a]P, присоединенный к экзоциклической аминогруппе гуанина (BPDE-N2-dG), и АР-сайт в различных положениях комплементарной цепи. Показано, что сродство XPC–RAD23B к ДНК-дуплексам, содержащим разные изомеры BPDE-N2-dG, определяется положением АР-сайта относительно объемного аддукта. ДНК с (+)-транс-BPDE-N2-dG более эффективно образует конъюгаты с белком независимо от положения АР-сайта в комплементарной цепи. Исследовано влияние XPC–RAD23B на гидролиз АР-сайта в составе кластера с BPDE-N2-dG, катализируемый ферментом ЭРО – апуриновой/апиримидиновой эндонуклеазой 1 (АРЕ1). Показано, что XPC–RAD23B стимулирует эндонуклеазную и ингибирует 3’–5′-экзонуклеазную активность АРЕ1. Полученные результаты демонстрируют возможность кооперации систем ЭРО и ЭРН в процессе исправления сложных повреждений ДНК.