БИОХИМИЯ, 2016, том 81, вып. 1, с. 68–77
УДК 577.217
Роль белка L25 и его контакта с белком L16 в поддержании активного состояния рибосомы Escherichia coli in vivo
Институт белка РАН, 142290 Пущино, Московская обл.; факс: +7(495)514-0218, электронная почта: gongadze@vega.protres.ru
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: 5S рРНК-связывающий белок L25, рибосомный белок L16, РНК-белковые взаимодействия, рибосома, трансляция, Escherichia coli.
Аннотация
Специфически связывающийся с 5S рРНК рибосомный белок семейства L25 является эволюционной особенностью бактерий. Структурные исследования показали, что этот белок в рибосоме образует контакты не только с 5S рРНК, но и с C-концевым участком белка L16. Ранее нами было показано, что рибосомы из ΔL25 штамма Escherichia coli имеют сниженную функциональную активность. В настоящей работе установлено, что причиной этого является фракция функционально неактивных 50S рибосомных субчастиц. Эти субчастицы имеют дефицит белка L16 и очень слабо ассоциируют с 30S субчастицами. Для изучения роли контакта этих двух белков в формировании активной рибосомы мы создали ряд штаммов E. coli, содержащих белок L16 с изменениями в C-концевой области. Оказалось, что некоторые мутации (K133L или K127L/K133L), внесенные в этот белок, приводят к заметному замедлению скорости роста клеток и снижению активности их аппарата трансляции. Как и в случае рибосом из ΔL25 штамма, в рибосомах полученных мутантных штаммов присутствует фракция 50S субчастиц, имеющих недостаток белка L16. Все эти данные указывают на то, что контакт с белком L25 важен для удержания белка L16 в рибосоме E. coli in vivo. В свете полученных данных обсуждается роль белка семейства L25 в поддержании функционально-активного состояния бактериальной рибосомы.