БИОХИМИЯ, 2016, том 81, вып. 1, с. 56–67
УДК 577.152.1
Эволюционная дивергенция классических пероксидаз Arabidopsis thaliana
Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова биологический факультет, 119991 Москва; электронная почта: ekupriyanova@gmail.com
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: пероксидаза, Arabidopsis thaliana, полиморфизм генов и белков, дупликации генов, эволюция, дивергенция свойств белка, биоинформатический анализ.
Аннотация
С целью изучения эволюционной динамики и дивергенции белков пероксидаз исследован полиморфизм 62 пероксидазных генов Arabidopsis thaliana. При сравнении дивергенции дуплицированных генов AtPrx53–AtPrx54 и AtPrx36–AtPrx72 и их продуктов были идентифицированы нуклеотидные и аминокислотные замены, которые, по-видимому, являлись мишенью позитивного отбора. Эти замены были выявлены и среди паралогов 461 расы Arabidopsis thaliana. Некоторые из этих замен оказались консервативными и маркировали паралогичные пероксидазы у других представителей капустных. Эти результаты свидетельствуют о том, что после дупликации гены эволюционировали под действием позитивного отбора, и идентифицированные замены аминокислотных остатков обеспечивали дивергенцию свойств и физиологических функций пероксидаз. Наши предсказания функциональной значимости идентифицированных аминокислотных остатков в вариабельных участках пероксидаз могут служить основанием для дальнейшей экспериментальной проверки путей эволюции пероксидаз после дупликации генов.