БИОХИМИЯ, 2015, том 80, вып. 4, с. 568–581
УДК 575:599.9
Активация генов RHOA и NKIRAS1 в опухолях легкого ассоциирована с потерей метилирования этих генов и с метилированием генов регуляторных микроРНК
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: CpG-островки, метилирование, микроРНК, гены-мишени, RHOA, NKIRAS1, мРНК, рак легкого.
Аннотация
Метилирование CpG-островков промоторных районов и взаимодействие микроРНК с матричными РНК генов-мишеней относятся к совокупности многоуровневых механизмов регуляции экспрессии генов. Цель настоящей работы – оценить возможность опосредованного влияния метилирования генов микроРНК на активацию их генов-мишеней в опухолях легкого. С использованием единой коллекции образцов немелкоклеточного рака легкого показано, что повышение уровня мРНК генов RHOA и NKIRAS1 статистически значимо (P < 10–11, по Спирману) ассоциировано как с потерей метилирования их CpG-островков, так и с метилированием ряда генов микроРНК, предсказанных как регуляторные по данным miRWalk. Определены новые потенциальные регуляторные микроРНК для RHOA (miR-9-1/-3, -34b/c, -129-2, -125b-1, -375, -1258) и NKIRAS1 (miR-34b/c, -129-2, -125b-1, -193a, -124a-1/-2/-3, -212, -132) при раке легкого.