БИОХИМИЯ, 2015, том 80, вып. 4, с. 517–526
УДК 577.1
Надмолекулярная организация фибрилл Hfq-подобных белков
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: Sm-подобные белки, Hfq, четвертичная структура белков, фибриллы.
Аннотация
Бактериальные белки семейства Hfq являются структурными гомологами архейных и эукариотических Sm/Lsm белков с характерной структурой из пяти-тяжевого β-листа и одной N-концевой α-спирали. Ранее было показано, что архейные Lsm белки (SmAP) способны спонтанно образовывать протяженные фибриллы, в то время как белок Hfq из Escherichia coli может их формировать только при определенных условиях. Архитектура этих фибрилл значительно различается, и причина таких различий в упаковке не была найдена. В данной работе исследованы фибриллы, образуемые белком Hfq из Pseudomonas aeruginosa и белком SmAP из археи Methanococcus jannaschii, имеющими высокую гомологию с белком Hfq из E. coli. Обнаружено, что белок Hfq из P. aeruginosa образует фибриллы только при заменах в консервативном аминокислотном мотиве Sm2, а белок SmAP из M. jannaschii способен их формировать спонтанно. Несмотря на то, что условия образования фибрилл исследованными белками различаются, упаковка гексамеров оказалась аналогичной той, что была предложена для фибрилл Hfq из E. coli. Это позволяет предполагать универсальный характер архитектуры фибрилл, образуемых белками Hfq.