БИОХИМИЯ, 2015, том 80, вып. 4, с. 497–507
УДК 577.214
pH может играть роль в регуляции активности PAH доменов путем изменения иx структуры и термодинамической стабильности
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: cтруктура белка, термодинамическая стабильность, круговой дихроизм, регулятор транскрипции, адапторный белок.
Аннотация
Регулятор транскрипции Sin3B в клетках человека (hSin3B) представляет собой адапторный белок (scaffold protein), который взаимодействует с различными транскрипционными факторами и регулирует транскрипцию. Он состоит из шести консервативных доменов: домена, взаимодействующего с деацетилазой гистонов (HID), высококонсервативного участка (HCR) и четыреx парныx амфифильныx спиралей (PAH 1–4). Интересно, что PAH домены белка hSin3B в значительной мере гомологичны друг другу, однако каждый из них взаимодействует со строго специфичным набором транскрипционных факторов. Несмотря на то, что различные факторы, взаимодействующие с PAH доменами белка hSin3B, были охарактеризованы, информации о структуре отдельных PAH доменов hSin3B в литературе нет. В настоящей работе мы охарактеризовали структуру и стабильность различных PAH доменов белка hSin3B пpи физиологических значенияx pH, а также при значениях pH, характерных для ядра. Мы показали, что структура нативного состояния и стабильность различных PAH доменов различается при значениях pH, характерных для ядра, при которых hSin3B выполняет свою биологическую функцию. Мы также показали, что структура нативного состояния и термодинамическая стабильность доменов PAH2 и РAH3 при значениях pH, характерных для ядра, отличается от таковых при физиологических значениях pH, тогда как структура домена PAH1 остается неизменной при обоих значениях pH. Полученные результаты свидетельствуют о том, что структурная гетерогенность PAH доменов может обусловливать уникальность набора связываемых транскрипционных факторов.