БИОХИМИЯ, 2015, том 80, вып. 3, с. 320–338
УДК 577.112.853
Протеомный анализ N-гликопротеинов синусоидальной поверхности клеток печени крыс с помощью аффинного концентрирования и масс-спектрометрического анализа
Обзор
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: эндотелиальная синусоидальная поверхность печени, N-гликопротеомный, N-глико-FASP, масс-спектрометрия.
Аннотация
Гликозилирование белков в клетках печени является одним из наиболее важных видов модификации белков. Гликозилирование белков играет важную роль во многих физиологических и патологических процессах, обусловленную их особым расположением на границе раздела между кровью и тканью, включая ангиогенез, рак, цирроз и фиброз печени. Чтобы проанализировать белки плазматической мембраны клеток синусоидального эндотелия печени (LSEC PM – liver sinusoidal endothelial cells, plasmatic membrane), N-гликопротеины, расположенные на поверхности LSEC PM, были сконцентрированы благодаря их аффинному связыванию с лектинами, находящимися на фильтрах, и затем были идентифицированы с помощью метода масс-спектрометрии. В целом было выявлено 225 уникальных сайтов N-гликозилирования в 152 гликопротеинах, из которых 119 (53%) сайтов были обнаружены впервые и ранее не определялись экспериментально. Среди идентифицированных гликопротеинов 53% белков были идентифицированы как белки плазматической мембраны и 47 гликопротеинов (31%) – как сигнальные белки и рецепторы. Кроме того, среди мембраносвязанных гликопротеинов LSEC PM было обнаружено 23 антигена кластера дифференциации (CD – cluster of differentiation) с 49 гликопептидами. Методами биоинформатического анализа было установлено, что большинство идентифицированных гликопротеинов оказывает влияние на процессы, происходящие в LSEC. Следовательно, N-гликопротеомный анализ LSEC PM может обеспечить получение необходимой информации, касающейся регенерации печени, и облегчить проведение диагностики заболеваний печени.