БИОХИМИЯ, 2014, том 79, вып. 12, с. 1715–1723
УДК 577.218
Короткие открытые рамки считывания регулируют трансляцию длинной изоформы мРНК гена SLAMF1, кодирующего костимуляторный рецептор CD150
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: биосинтез белка, регуляция трансляции, кОРС, мРНК.
Аннотация
Более 40% генов человека содержат в 5′-нетранслируемых областях (5′-НТО) короткие открытые рамки считывания (кОРС), уменьшающие эффективность трансляции основного белка, и кроме того экспрессируют хотя бы одну укороченную изоформу мРНК, не содержащую кОРС. Мы исследовали регуляцию трансляции мРНК гена SLAMF1. Данный ген кодирует мембранный белок CD150 – член CD2 суперсемейства, костимуляторный рецептор лимфоцитов, рецептор вируса кори и микробный сенсор макрофагов. Транскрипты гена SLAMF1 представлены как минимум двумя изоформами, отличающимися длиной 5′-НТО. В длинной изоформе мРНК SLAMF1, содержащей в 5′-НТО четыре кОРС, стоп-кодон кОРС4 перекрывается с AUG-кодоном основной рамки, образуя потенциальный сайт терминации-реинициации UGAUG, а между стартами кОРС2 и кОРС3 находится последовательность, идентичная т.н. «мотиву 1» из последовательности TURBS. Эта последовательность присутствует в полицистронных РНК некоторых вирусов и необходима для реализации механизма сопряженной терминации-реинициации при их трансляции. В модельной клеточной системе репортерная мРНК на основе 5′-НТО короткой изоформы мРНК SLAMF1, не содержащей кОРС, транслируется в 5–6 раз эффективнее, чем мРНК с 5′-НТО длинной изоформы. Нуклеотидные замены, разрушающие старт-кодоны кОРС2-4, существенно повышают эффективность трансляции репортерной РНК, в то время как замена двух нуклеотидов в составе «мотива 1» TURBS снижает ее вдвое. Эти данные позволяют предположить, что TURBS-подобные элементы могут быть задействованы в регуляции трансляции некоторых клеточных мРНК, содержащих кОРС.