БИОХИМИЯ, 2014, том 79, вып. 8, с. 1042–1051
УДК 577.152.3
Характеристика индуцируемых повреждением генов ингибиторов протеаз (WIP1) и кодируемых ими белков в турецких сортах кукурузы
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: ингибиторы протеаз, индуцируемый повреждением белок, семейство ингибиторов Боумана–Берка, кукуруза из Турции.
Аннотация
Ингибиторы протеаз (protease inhibitors – PIs), выделенные из растений, являются в основном небольшими белками. Коды доступа для индуцируемых повреждениями wip1 генов очень напоминают коды доступа для семейства ингибиторов сериновых протеаз Боумана–Берка (Bowman–Birk family of serine PIs – BBIs). Для изучения структуры и характеристики wip1 генов и кодируемых ими белков проанализировано десять wip1 генов турецких сортов кукурузы. Обнаружено, что генетическое разнообразие wip1 генов больше (π: 0,0173), чем отмечалось в предыдущих работах. Значение D в тесте Таджимы было положительным (1,73), что предполагает сверхдоминантную селекцию в этих локусах. При филогенетическом анализе wip1 белков выявлено, что BBIs однодольных и двудольных растений располагались независимо друг от друга, а турецкие сорта, наоборот, кластеризовались вместе. 3D структуры wip1 белков указывают на то, что отдельные wip1 белки структурно отличаются в активных локусах, содержащих от 7–9 остатков цистеина. В частности, cys74 был идентифицирован в сортах Kocbey и Gozdem, cys98 присутствует только в сорте Gozdem; исследование критических остатков серина показало, что дополнительный остаток серина присутствует в двух сортах: Antbey и Batem Efe. Эти результаты помогут понять роль wip1 генов кукурузы и кодируемых ими белков.