БИОХИМИЯ, 2014, том 79, вып. 8, с. 1009–1014
УДК 577.152.1
Взаимодействие гидрогеназы HYDSL пурпурной серной бактерии Thiocapsa roseopersicina BBS с метилвиологеном и положительно заряженными полипептидами
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: гидрогеназа, метилвиологен, полипептиды, конкурентное ингибирование, молекулярный докинг.
Аннотация
Исследовано действие ряда полипептидов с различным зарядом на активность гидрогеназы Thiocapsa roseopersicina. Показан сильный ингибирующий эффект полилизина (К20), имеющего положительный заряд. Ингибирующее действие полилизина было обратимым и конкурентным по отношению к акцептору электронов – окисленному метилвиологену в реакции окисления водорода, катализируемой гидрогеназой. Полипептиды с меньшим положительным зарядом производили меньший ингибиторный эффект, а незаряженные полипептиды и полипептиды с отрицательным зарядом не проявляли ингибирующего эффекта на гидрогеназу. Моделирование взаимодействия (докинг) полилизина с гидрогеназой T. roseopersicina указывает на высокое сродство акцептор-связывающего центра фермента к этому полипептиду. Рассчитанная величина константы связывания полилизина с гидрогеназой близка к экспериментально определенной (Ki = 2,1 мкМ).