БИОХИМИЯ, 2014, том 79, вып. 5, с. 595–604
УДК 577.1
Влияние замен консервативных аминокислотных остатков на структуру и стабильность белка Hfq
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: Hfq, пространственная структура, четвертичная структура, термостабильность белков.
Аннотация
Белок Hfq является термостабильным РНК-связывающим бактериальным белком, формирующим характерную четвертичную структуру в виде гомогексамеров. На основе гомологии первичных и пространственных структур белок Hfq относят к семейству Sm-подобных (Sm-like или LSm) белков. Однако, несмотря на высокую степень гомологии с бактериальным LSm белком Hfq, архейные и эукариотические LSm белки формируют гептамеры; имеются примеры пентамера и октамера. В данной работе мы исследовали влияние консервативных межсубъединичных водородных связей на пространственную организацию белка Hfq. Были определены структуры и стабильность мутантных форм белка Hfq с единичными заменами Gln8Ala, Asn28Ala, Asp40Ala и Tyr55Ala. Все полученные белки имели одинаковую гексамерную организацию, но различную стабильность. Удаление одной межсубъединичной водородной связи в случае замен Gln8Ala, Asp40Ala и Tyr55Ala приводило к понижению стабильности гексамера Hfq. Белок Tyr55Ala Hfq, так же как и ранее исследованный His57Ala Hfq, обладал пониженной термостабильностью, по всей видимости, из-за увеличения доступности гидрофобного ядра для молекул растворителя.