БИОХИМИЯ, 2013, том 78, вып. 10, с. 1405–1411
УДК 577.2.01,577.29,519.173
Биоинформационный анализ белковых сетей: поиск статистик и топологий, наиболее адекватно отвечающих запросам экспериментальных биологов
Мини-обзор
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: биоинформатика, сети белковых взаимодействий, безразмерные сети, вероятностно-статистические модели, интерактом дрожжей, интерактом арабидопсиса.
Аннотация
Биоинформационный анализ сетей белковых взаимодействий позволил сделать несколько важных предсказаний, получивших в последние годы экспериментальное подтверждение. Согласно популярной модели теории биологических сетей, белковые сети являются безразмерными (scale-free), так же как транспортные сети, Интернет и социальные сети. Существует и альтернативная точка зрения на топологию белковых цепей, согласно которой они существенно отличаются по свойствам от безразмерных сетей. В данной работе мы показываем, что имеющаяся в настоящее время информация недостаточна для того, чтобы описывать белковые сети как безразмерные.