БИОХИМИЯ, 2013, том 78, вып. 7, с. 938–948
УДК 577.114.5,577.124.5
Специфичность связывания гепарансульфатов с белками
Обзор
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: гепарин, гепарансульфат, глюкозаминогликаны, протеогликаны, связывание с белком, биоинформатика.
Аннотация
Гепарансульфаты (ГС) представляют собой большой класс линейных полисахаридов, необходимых для функционирования всех физиологических систем организма млекопитающих. ГС содержат остов, состоящий из повторяющихся дисахаридных единиц, которые подвергаются широкому спектру химических модификаций, превращающих их в наиболее насыщенный информацией класс макромолекул во всей биологии. Функции ГС основаны на их способности связываться с белками и регулировать их действие. Исследования ГС в последние годы носят взрывной характер и привели к обнаружению новых видов их активности. В настоящее время является общепризнанным, что этот класс гликанов может функционировать в качестве корецепторов для факторов роста и цитокинов, участвовать в модуляции поглощения клеткой липидов, регулировать протеазную активность, играть важную роль в формировании амилоидной бляшки, использоваться условно-патогенными микроорганизмами для проникновения внутрь клеток и может даже участвовать в эпигенетической регуляции. Настоящий обзор посвящен обсуждению современных представлений о специфичности связывания ГС с белками и описанию концепции, основанной на том, что связывание белков с ГС зависит больше от их общей доменной организации, чем от тонкой структуры.