БИОХИМИЯ, 2013, том 78, вып. 4, с. 481–491
УДК 578.088
Роль транс- и цис-взаимодействий в проявлении амилоидогенных свойств вариабельных доменов белков Бенс-Джонса TIM и LUS
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: белки Бенс-Джонса, амилоидные фибриллы, вариабельные домены, свободная энергия стабилизации, междоменные взаимодействия.
Аннотация
Интактные белки Бенс-Джонса TIM и LUS при условиях, имитирующих физиологические (10 мМ фосфатный буфер, рН 7,0, 100 мM NaCl, 37°) не проявляют амилоидогенных свойств. При этом их изолированные вариабельные домены проявляют эти свойства в полной мере. Поэтому как первые, так и вторые были исследованы с помощью комплекса физических методов, позволяющих судить о стабильности их третичной и четвертичной структур (сканирующая микрокалориметрия, аналитическое центрифугирование, оптика). Полученные на основе экспериментальных данных термодинамические функции свидетельствуют, что стабильность изолированных вариабельных доменов TIM и LUS сравнима со стабильностью аналогичных доменов у ряда амилоидогенных белков, ранее исследованных и описанных нами и другими авторами. Однако в составе целых белков она сопоставима уже со стабильностью VL-доменов для обычных белков Бенс-Джонса. Анализ показывает, что для изолированных вариабельных доменов TIM и LUS понижение стабильности обусловлено как слабыми взаимодействиями между парой вариабельных доменов (транc-взаимодействия), так и естественным отсутствием взаимодействия с константными доменами (цис-взаимодействия).