БИОХИМИЯ, 2013, том 78, вып. 4, с. 442–450
УДК 577.21
Двунаправленные промоторы в геноме млекопитающих
Обзор
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: структура генома, двунаправленные промоторы, дивергентная транскрипция, транскриптом, «кор»-промоторные элементы, инициация транскрипции, CpG-островки, факторы транскрипции, короткие некодирующие РНК.
Аннотация
В геномах человека и других млекопитающих выявлено большое число близкорасположенных пар генов, которые транскрибируются в противоположных направлениях. Их транскрипция направляется так называемыми двунаправленными промоторами. Обзор посвящен характеристике двунаправленных промоторов и особенностям их строения. Сравнивается состав «кор»-промоторных элементов в обычных однонаправленных и двунаправленных промоторах. Рассмотрены данные о сайтах связывания факторов транскрипции, в первую очередь, специфичных для двунаправленных промоторов. Приведены примеры промоторов, разделяющих белок-кодирующие гены, транскрибируемые РНК полимеразой II, и гены некодирующих РНК, транскрибируемых РНК полимеразой III. Обсуждаются полученные в ходе глобального анализа транскриптомов данные о существовании коротких некодирующих антисмысловых РНК, ассоциированных с промоторами, в свете гипотезы о двунаправленной инициации транскрипции как неотъемлемом свойстве эукариотических промоторов.