БИОХИМИЯ, 2013, том 78, вып. 2, с. 230–242
УДК 577.121
Взаимодействие коротких пептидов с FITC-мечеными гистонами пшеницы и их комплексами с дезоксирибоолигонуклеотидами
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: гистоны, короткие пептиды, взаимодействие, связывание, комплексы гистон–олигонуклеотид–пептид, метилирование ДНК, пшеница, растения, эпигенетика.
Аннотация
С помощью тушения флуоресценции показано, что короткие пептиды (Ala-Glu-Asp-Gly, Glu-Asp-Arg, Ala-Glu-Asp-Leu, Lys-Glu-Asp-Gly, Ala-Glu-Asp-Arg и Lys-Glu-Asp-Trp) связываются с FITC-мечеными гистонами пшеницы Н1, H2в, H3 и H4. В случае гистона Н1 тушение флуоресценции происходит за счет взаимодействия пептидов с N-концевыми областями гистонов, которые содержат соответствующие гомологичные пептид-связывающие мотивы. Так как в кор-гистонах пшеницы гомологичные аминокислотные последовательности нами не найдены, пептиды, по-видимому, связываются с некими особыми конформационными участками этих гистонов. Связывание пептидов с гистонами и комплексами гистон–дезоксирибоолигонуклеотид зависит от природы гистона, первичной структуры пептида и олигонуклеотида, т.е. существует сайт-специфическое взаимодействие коротких пептидов с гистонами и комплексами гистон–олигонуклеотид. Гистон Н1 предпочтительно связывается с однотяжевыми олигонуклеотидами через гомологичные участки в С-концевой области белка. В отличие от гистона Н1, коровые гистоны преимущественно связываются с двутяжевыми метилированными олигонуклеотидами и метилированной ДНК. Константы Штерна–Фольмера взаимодействия гистонов Н1 и кор-гистонов с двутяжевыми полуметилированными олигонуклеотидами выше, чем с неметилированными. ДНК или дезоксирибоолигонуклеотиды в составе комплекса с гистонами могут усиливать или препятствовать связыванию пептидов. Предполагается, что сайтспецифические взаимодействия коротких пептидов с гистонами в хроматине могут служить контрольным эпигенетическим механизмом регуляции активности генов и клеточной дифференцировки.