Влияние аффинного сорбента на протеомное профилирование изатинсвязывающих белков мозга мыши

Аннотация

Использование малых молекул для выделения конкретных групп белков часто осложняется необходимостью химической модификации исходного вещества для подготовки аффинного сорбента. Изатин (индолдион-2,3) – эндогенное вещество, обладающее широким спектром биологической активности. В результате недавно проведенного протеомного профилирования гомогенатов мозга мыши и крысы с использованием 5-аминокапроилизатина мы идентифицировали >60 различных белков. Однако при проверке изатинсвязывающей активности некоторых идентифицированных белков, проведенной с использованием оптического биосенсора, оказалось, что они характеризуются различным сродством к иммобилизованным в качестве аффинного лиганда 5-аминокапроилизатину и 5-аминоизатину. В данном исследовании проведена сравнительная оценка протеомных профилей изатинсвязывающих белков, выделенных с помощью обоих аналогов изатина. Число идентифицированных белков было выше при использовании более короткого аналога изатина (88 против 66), причем только 22 белка были общими для обоих протеомных профилей. Полученные результаты свидетельствуют о том, что длина вставки между аминогруппой, используемой для пришивки аффинного лиганда к сефарозе, и собственно изатином существенно влияет на протеомное профилирование изатинсвязывающих белков мозга, а также о том, что истинное число белков мозга, взаимодействующих с эндогенным (немодифицированным) изатином, по-прежнему остается недоучтенным из-за неодинакового сродства различных белков мозга к аналогам изатина, использованным для протеомного профилирования.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: