Организация хлоропластного межгенного спейсера psbA-trnH у двудольных покрытосеменных растений семейства зонтичных (Umbelliferae)

Аннотация

На примере семейства зонтичных изучена организация хлоропластного межгенного спейсера psbA-trnH, который в последнее время приобрел популярность в молекулярно-филогенетических исследованиях на низком таксономическом уровне и в ДНК-штрихкодировании. Организация спейсера у зонтичных согласуется с общей схемой, предложенной для покрытосеменных растений. Высокая консервативность области спейсера, прилегающей к гену psbA, обусловлена функциональной нагрузкой, связанной с необходимостью образования шпильки для поддержания стабильности мРНК после процессинга. Однако только в пределах зонтичных в данной высококонсервативной области происходило удвоение фрагмента, соответствующего петле шпильки, а также независимое возникновение в разных родственных линиях сходных замен, приводящих к стабилизации стебля шпильки. 3′-Область спейсера, прилегающая к гену trnH, отличается сильной вариабельностью по длине, вызванной присутствием большого числа делеций в разных группах зонтичных. Выявленные особенности позволяют использовать спейсер в качестве филогенетического маркера, при этом наиболее информативными оказываются не точечные замены, а вставки/выпадения отдельных фрагментов. Однако высокая консервативность у близкородственных таксонов и наличие гомопластичных инверсий в области шпильки сильно ограничивают возможности использования спейсера как ДНК-штрихкода в семействе зонтичных.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: