БИОХИМИЯ, 2012, том 77, вып. 6, с. 713–720
УДК 577.123
Характеристика молекулярной структуры вырезаемого участка 28S рРНК креветки Artemia parthenogenetica и планарии Dugesia japonica*
College of Life Sciences, Shaanxi Normal University
Поступила в редакцию 25.11.2011
После доработки 20.02.2012
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: 28S рРНК, gap-участок, фрагментация, Artemia parthenogenetica, Dugesia japonica.
Аннотация
Для большинства насекомых и некоторых первичноротых (Protostomia) удаление из зрелых молекул 28S рРНК небольшого участка нуклеотидной последовательности могло приводить к образованию двух субъединиц 28S рРНК (28Sα и 28Sβ). Поэтому при электрофорезе в денатурирующих условиях рРНК этих организмов могут вести себя нестандартно, так как обе их субъединицы мигрируют одной полосой, соответствующей 18S рРНК. Для изучения структуры и механизма образования нетипичной молекулы 28S рРНК неполные фрагменты 28Sα и 28Sβ из креветки Artemia parthenogenetica и планарии Dugesia japonica были клонированы с использованием модифицированной методики, основанной на применении терминальной трансферазы. Сопоставление нуклеотидных последовательностей этих фрагментов с соответствующими последовательностями 28S рДНК показало, что в зрелых рРНК из A. parthenogenetica и D. japonica отсутствуют участки размером 41 и 42 нуклеотида соответственно. В этих участках, иссеченных из 28S рРНК в D. japonica или A. parthenogenetica, довольно высокое содержание AU-пар. Обе иссеченные последовательности могут формировать «шпильки». Консервативная сигнальная последовательность (UAAU) идентифицирована в петле рРНК из D. japonica, но отсутствует у рРНК из A. parthenogenetica. Мы предположили, что посттрансляционный процессинг 28S рРНК, заключающийся в удалении из нее этого gap-участка, связан с ферментативным расщеплением рРНК на поздней стадии ее созревания. Этот процесс основан на присутствии в молекуле рРНК нуклеотидной gap-последовательности, обогащенной AU-парами и образующей шпильковые структуры, служащие для экспонирования удаляемого сегмента. Делеция gap-последовательности, по-видимому, не нарушает структуру и функционирование молекулы 28S рРНК.
Текст статьи
Сноски
# Авторы, внесшие равноценный вклад в эту работу.
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM11-307, 18.03.2012.
** Адресаты для корреспонденции.