Корреляция между биологической активностью и конформационно-динамическими свойствами тетра- и пентапептидных фрагментов фетоплацентарных белков

Аннотация

С использованием метода молекулярной динамики изучены конформационно-динамические свойства биологически активных пента- и тетрапептидных фрагментов альфа-фетопротеина, PSG (pregnancy specific β1-glycoprotein) и CEA (carcinoembryonic antigen). Выявлено, что существует корреляция между жесткостью пептидного остова и биологической активностью изученных пептидов. Также показано, что гибкость пептидного остова определяется не только длиной пептидной цепи, но и ее аминокислотным составом, т.е. содержанием реакционноспособных остатков, характеризующихся наличием в боковом радикале заряженных или полярных групп. Оказалось, что пептиды разной длины (LDSYQCT, PYECE, YECE, YVCE), демонстрирующие сходный биологический эффект в регуляции пролиферации лимфоцитов и экспрессии дифференцировочных антигенов на их поверхности, характеризуются достаточно жестким пептидным остовом. Увеличение гибкости пептидной цепи в пептидах (PYQCE, YQCE, SYKCE, YQCT, YQCS, YVCS, YACS и YACE) сопровождается уменьшением биологической активности. Таким образом, различия в биологической активности пептидов (видимо, и белков) обусловлены не только различиями в физико-химических свойствах аминокислотных остатков, из которых они состоят, но и в их конформационно-динамических свойствах, которые, в свою очередь, во многом зависят от внутри- и межмолекулярных взаимодействий, возникающих в молекулах пептидов (и белков). По-видимому, молекулярная эволюция направлена на сохранность внутримолекулярных взаимодействий, обеспечивающих поддержание пространственной структуры в окружении функционально важных участков белков.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: