3':5'-AMP-индуцированный конформационный переход регуляторной субъединицы протеинкиназы А Iα запускается ключевыми остатками A202 и A326. Ч. I^*

Аннотация

Методами молекулярной динамики и лиганд-рецепторного докинга показано, что ключевым событием, инициируемым 3′:5′-AMP при связывании c А- и В-доменами протеинкиназы А Iα, является образование водородной связи между 3′:5′-AMP и A202(A326). Движение амидной группы A202(A326), без которого невозможно образование этой связи, приводит к переходу короткой 3₁₀-спирали фосфатсвязывающей кассеты в более длинную α-спираль. Результатом этого процесса является смещение остатка L203(L327), что, в свою очередь, делает возможным поворот B-спирали. Вторым условием смещения остатка L203(L327) и «упаковки» его в гидрофобный карман, образованный фосфатсвязывающей кассетой и β2β3-петлей, является определенная пространственная ориентация β2β3-петли. Такая ориентация поддерживается остатками R, I, E, но не K в положении 209(333). В результате затруднен переход в В-конформацию А- и В-доменов протеинкиназы А Iα, несущих точечные мутации R209K и R333K соответственно. 3′:5′-AMP-Связывающий домен в отсутствие 3′:5′-AMP тоже переходит в B-конформацию. В данном случае движущей силой смещения амидной группы A202(A326), вероятно, является реорганизация спирали фосфатсвязывающей кассеты в более выгодную α-конформацию.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: