БИОХИМИЯ, 2012, том 77, вып. 2, с. 205–211
УДК 577.152.361
Быстрая кинетика присоединения нуклеотидов к содержащей CBS- и DRTGG-домены пирофосфатазе семейства II из Clostridium perfringens*
1 Department of Biochemistry and Food Chemistry, University of Turku
2 НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского МГУ им. М.В. Ломоносова
Поступила в редакцию 26.09.2011
После доработки 26.10.2011
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: неорганическая пирофосфатаза, CBS-домен, DRTGG-домен, Clostridia perfringens, адениновые нуклеотиды, диаденозинполифосфат.
Аннотация
Ранее мы описали CBS-пирофосфатазу из Moorella thermoacetica (mtCBS-PPase) как новую фосфогидролазу, которая приобрела в процессе эволюции пару нуклеотид-связывающих CBS-доменов и, благодаря этому, аллостерически регулируется адениновыми нуклеотидами [Jamsen, J., Tuominen, H., Salminen, A., Belogurov, G.A., Magretova, N.N., Baykov, A.A., and Lahti, R. (2007) Biochem. J., 408, 327–333]. Данная публикация посвящена более сложной CBS-пирофосфатазе из Clostridium perfringens (cpCBS-РРазе), которая дополнительно имеет в регуляторной части DRTGG-домен, расположенный между CBS-доменами. cpCBS-РРаза также ингибируется микромолярными концентрациями AMP и ADP и активируется под действием ATP, но, кроме того, активируется диаденозинполифосфатами (APnA) с n > 2. Методом остановленной струи с использованием флуорецентного аналога нуклеотида, 2′(3′)-O-(N-метилантраноил)-AMP, показано, что изменение конформации cpCBS-РРазы при связывании нуклеотида происходит в две стадии с характеристическими временами в миллисекундной шкале. Эти результаты дают основания предположить, что DRTGG-домен способствует большей подвижности структуры в регуляторной части и таким образом ускоряет конформационные изменения, вызываемые связыванием нуклеотида.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM 11-274, 08.01.2012.
** Адресат для корреспонденции.