БИОХИМИЯ, 2011, том 76, вып. 11, с. 1576–1582
УДК 577.112.7+573.6.086.83
Надмолекулярные комплексы белка вирулентности VirE2 Agrobacterium tumefaciens
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: Agrobacterium tumefaciens, белок вирулентности VirE2, надмолекулярные комплексы, Т-ДНК, поры, биоинформатика.
Аннотация
Белок вирулентности VirE2 из Agrobacterium tumefaciens участвует в инфицировании растений, обеспечивая перенос фрагмента Ti-плазмиды агробактерий ssТ-ДНК в комплексе с белками VirE2–VirD2 в ядро растительной клетки. Изучены взаимодействия белка VirE2 с ssДНК и образование комплексов белка VirE2 in vitro и in silica. Методом динамического светорассеяния установлено, что очищенный рекомбинантный белок VirE2 в буферном растворе существует в виде комплексов из 2–4 молекул белка VirE2 размером 12–18 нм. С помощью компьютерных методов построены модели комплексов, состоящие из двух и четырех индивидуальных белков VirE2, и оценены их размеры. С помощью трансмиссионной электронной микроскопии и методом динамического светорассеяния определены размеры комплексов белка VirE2 с ssДНК (550 и 700 нуклеотидных остатков). Показано, что рекомбинантный белок VirE2 в условиях in vitro при взаимодействии с ssДНК может менять ее конформацию, уменьшая первоначальную длину ssДНК.