БИОХИМИЯ, 2011, том 76, вып. 8, с. 1120–1131
УДК 577.217
Идентификация A→I редактирования РНК: расставление точек над i в транскриптоме человека
Обзор
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: редактирование РНК, A→I редактирование, инозин, процессинг РНК, разнообразие транскриптома, секвенирование РНК, геном человека.
Аннотация
Феномен превращения аденозина в инозин (A→I редактирование) в составе РНК привлекает внимание научного сообщества в связи с его возможными связями с эволюцией когнитивных способностей животных. Несмотря на то, что A→I редактирование происходит у всех животных, имеющих нейроны, в том числе у животных с примитивной нервной системой (гидра и нематоды), наиболее часто оно наблюдается у организмов с высокоразвитой центральной нервной системой (у приматов и особенно у человека). Разнообразие последовательностей транскриптов, полученное путем A→I редактирования, необходимо для осуществления различных функций, например, изменение закодированных в геноме определенных аминокислотных остатков белков, изменение сайтов сплайсинга, а также управление регуляцией альтернативного сплайсинга мРНК. Мы рассматриваем имеющиеся в настоящее время теоретические и практические подходы для выявления редактированных нуклеотидов в транскриптоме человека; обсуждаются существующие биоинформатические ресурсы для изучения редактирования РНК и дальнейшие перспективы развития этого направления.