БИОХИМИЯ, 2011, том 76, вып. 8, с. 1115–1119
УДК 577.217
Количественное определение редактирования РНК рецептора серотонина 2С
Обзор
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: ADAR, 5-HT2C, пиросеквенирование, высокопроизводительное секвенирование.
Аннотация
Пре-мРНК серотонинового рецептора 2С (HTR2C – 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2C) подвергается A→I редактированию РНК – постранскрипционной модификации, приводящей к изменению информации, закодированной в геноме. Редактирование РНК, кодирующей рецептор, приводит в ходе трансляции к образованию различных изоформ HTR2C, каждая из которых обладает определенной рецепторной активностью. Посмертное обследование больных, опыты на животных, а также фармакологические исследования выявили, что изменения уровня редактирования РНК HTR2C могут принимать участие в патофизиологии психических нарушений, хотя результаты данных исследований остаются противоречивыми. В данном обзоре представлены методы, используемые для количественной оценки редактирования РНК HTR2C. Метод, основанный на высокопроизводительном секвенировании, скорее всего, станет одним из самых мощных инструментов для крупномасштабных экспериментов. Ранее разработанные методики, такие как пиросеквенирование и капиллярный электрофорез, могут использоваться при проверке данных, а также для быстрого скрининга и других исследовательских целей.