БИОХИМИЯ, 2011, том 76, вып. 5, с. 692–700
УДК 577.15
Пространственные структуры нековалентных комплексов Citrobacter freundii метионин–γ-лиазы с субстратами
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: Citrobacter freundii метионин–γ-лиаза, пиридоксаль-5'-фосфат, комплексы с аминокислотами, пространственные структуры.
Аннотация
Решены и уточнены пространственные структуры комплексов Citrobacter freundii метионин–γ-лиазы с субстратами реакции γ-элиминирования (L-1-амино-3-метилтиопропилфосфиновой кислотой (1,45 Å)) и реакции β-элиминирования (S-этил-L-цистеином (1,8 Å)) и конкурентным ингибитором (L-норлейцином (1,63 Å)). Во всех трех комплексах аминокислоты располагаются в активном центре фермента, но не образуют с пиридоксаль-5′-фосфатом ковалентной связи. Возможной причиной наблюдаемого промежуточного положения субстратов и ингибитора может служить взаимодействие их боковых цепей с гидрофобными аминокислотными остатками активного центра фермента. Боковые группы остатков Arg374 и Ser339 участвуют в связывании карбоксильных групп субстратов и ингибитора. Гидроксильная группа остатка Tyr113 является потенциальным акцептором протона от аминогрупп аминокислот.