БИОХИМИЯ, 2011, том 76, вып. 2, с. 274–286
УДК 577.322
Бактериальные белки сворачиваются быстрее, чем эукариотические белки с простой кинетикой сворачивания
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: сворачивание белка, интермедиаты сворачивания, переход «все или ничего», скорость сворачивания, эукариотические и бактериальные белки.
Аннотация
Проведен статистический анализ встречаемости белковых доменов и их распределения по царствам для структурной базы SCOP. Оказалось, что среди отобранных белковых доменов с наилучшим разрешением эукариотические белки чаще относятся к структурным классам α-спиральных и β-структурных белков, а белки бактериального происхождения к структурному классу α/β. С помощью статистического анализа скоростей сворачивания 73 белков с известными экспериментально полученными данными обнаружено, что бактериальные белки с простой кинетикой (23 белка) сворачиваются быстрее, чем эукариотические белки с простой кинетикой сворачивания (27 белков). Анализ аминокислотного состава белковых доменов показал, что встречаемость аминокислотных остатков белков эукариотического и бактериального происхождения различна для белков с простой и со сложной кинетикой сворачивания.