БИОХИМИЯ, 2011, том 76, вып. 2, с. 211–213
УДК 577.152.121
Изучение транспорта формиата через субстратный канал формиатдегидрогеназы при помощи управляемой молекулярной динамики
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: формиатдегидрогеназа, субстратный канал, управляемая молекулярная динамика.
Аннотация
С помощью метода управляемой молекулярной динамики описан механизм транспорта формиата через субстратный канал формиатдегидрогеназы. Показано, что структурная организация канала хорошо приспособлена к транспорту субстрата, несмотря на то, что он достаточно узок даже для столь малой молекулы. Конформационная мобильность Arg284, одного из остатков, формирующих стенки канала, обеспечивает связывание и доставку формиата в активный центр.