БИОХИМИЯ, 2010, том 75, вып. 12, с. 1695–1711
УДК 577.112
Протеомный анализ хлоропластов мха Physcomitrella patens (Hedw.) B.S.G.
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: протеом, хлоропласты, Physcomitrella patens, фотосинтез, субклеточная локализация.
Аннотация
Из протопластов мха Physcomitrella patens по специально разработанной методике получены интактные хлоропласты, которые подвергали дополнительному фракционированию для получения стромальной и тилакоидной фракций. Проведен протеомный анализ интактных пластид, а также фракций стромы и тилакоидов с помощью 1D-электрофореза в денатурирующих условиях с последующим анализом триптических пептидов методом nano-LC-ESI-MS/MS. Идентифицировано 624 уникальных белков, 434 из которых аннотированы как белки-резиденты хлоропластов. Из них значительную долю (21,3%) составляли белки, участвующие в процессе фотосинтеза, а также связанные с процессом деградации, пострансляционной модификации, фолдинга и импорта белков (20,6%). Среди белков, аннотированных как хлоропластные, выделяются группы белков, вовлеченных в метаболизм аминокислот (6,9%), нуклеотидов (2,5%), липидов (2,2%), углеводов (2,4%), гормонов (1,5%), изопреноидов (1,25%), витаминов и кофакторов (1%), серы (1,25%), азота (1%), пентозо-фосфатный цикл (1,75%), синтез тетрапирролов (3,7%), процессы окисления-восстановления (3,6%) и другие. Полученные результаты могут быть использованы в физиологических и фотобиологических исследованиях, а также для дальнейшего исследования белков хлоропластного протеома P. patens и установления структурно-функциональных особенностей локализации белков в органеллах растений.