БИОХИМИЯ, 2010, том 75, вып. 11, с. 1560–1570
УДК 577.151.01
Квазиравновесное приближение в случае двусубстратной упорядоченной ферментативной реакции. Проблемы дискриминации механизмов
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: ферментативная кинетика, двусубстратные реакции, квазиравновесное приближение, метод Ча, быстрое равновесие, точность приближения, стационарная кинетика, метод графов, дискриминация механизмов.
Аннотация
Рассмотрено применение квазиравновесного приближения для стационарной кинетики двусубстратных необратимых ферментативных реакций в случае упорядоченного характера присоединения субстратов («Bi-Bi ordered»-механизм). Найдены необходимые и достаточные условия применения квазиравновесного приближения и получены выражения для определения точности этого приближения. Показана ограниченность применения квазиравновесного приближения и проанализированы ошибки при его применении. Показано, что возможность дискриминации порядка присоединения субстратов с использованием возникающих при квазиравновесном приближении асимметричных выражений иллюзорная, потому что такая асимметрия – артефакт необоснованного применения квазиравновесного приближения. Более того, в общем виде доказано, что не существует механизмов, порождающих такие асимметричные по отношению к субстратам выражения для стационарной скорости ферментативной реакции. Определен источник ошибок при использовании графической интерпретации для дискриминации механизмов двусубстратных ферментативных реакций и указан способ, позволяющий таких ошибок избежать.