БИОХИМИЯ, 2010, том 75, вып. 10, с. 1395–1408
УДК 577.123
Прочносвязанные с ДНК белки: новые данные и старые проблемы
Обзор
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: прочносвязанные с ДНК белки, ядерный матрикс, повторяющиеся последовательности ДНК, серпины, фосфатазы, факторы транскрипции, дифференцировка.
Аннотация
Прочносвязанные с ДНК белки (ПСБ) – группа белков, которые остаются связанными с ДНК после обычных процедур депротеинизации: высаливания, обработки фенолом или хлороформом. ПСБ связываются с ДНК ковалентными триэфирными и нековалентными ионными и водородными связями. Часть ПСБ консервативна, по всей видимости, это ковалентно связанные с ДНК белки. В то же время состав ПСБ очень разнообразен и значительно различается в тканях и у разных организмов. ПСБ – это факторы транскрипции, ферменты убиквитин-протеасомной системы, фосфатазы, протеинкиназы, серпины и белки ретротранспозонов. ПСБ распределены по геному не случайно. Однако первичная структура ДНК или изгибы ДНК не определяют сродство к ней ПСБ. Но существуют повторяющиеся последовательности ДНК, с которыми ПСБ чаще взаимодействуют, чем с другими. Распределение ПСБ в генах и хромосомах зависит от физиологического состояния клеток, типа дифференцировки и стадии развития организма. ПСБ взаимодействуют с ДНК не в местах ее ассоциации с ядерным матриксом и скорее всего не являются компонентами ядерного матрикса.