БИОХИМИЯ, 2010, том 75, вып. 9, с. 1244–1256
УДК 577.151
Ингибирование ДНК-метилтрансферазы мыши Dnmt3a ДНК-дуплексами, содержащими пиримидин-2(1H)-ОН
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: пиримидин-2(1H)-он, ковалентный интермедиат, конкурентное ингибирование, эукариотическая ДНК-метилтрансфераза.
Аннотация
Изучено ингибирование каталитического домена эукариотической ДНК-метилтрансферазы Dnmt3a (Dnmt3a-CD) ДНК-дуплексами, содержащими механизмзависимый ингибитор пиримидин-2(1H)-он (P). Показано, что ДНК-дуплексы, содержащие остаток P в позиции метилируемого цитозина (Р-ДНК), способны образовывать ковалентные интермедиаты с Dnmt3a-CD. Обнаружено, что конъюгаты Dnmt3a-CD с P-ДНК разрушаются при нагревании до 65° в 0,1%-ном Ds-Na. В присутствии регуляторного фактора Dnmt3L выход ковалентного интермедиата увеличивается. Обнаружено, что малая бороздка ДНК важна для образования ковалентного интермедиата Dnmt3a с ДНК в процессе реакции метилирования. Показано, что P-ДНК способна ингибировать Dnmt3a-CD (IC50 = 830 нм). Выявлен конкурентный механизм ингибирования Dnmt3a-CD ДНК, содержащей P. Высказано предположение, что терапевтический эффект зебуларина может быть обусловлен ингибированием не только Dnmt1, но и Dnmt3a.