БИОХИМИЯ, 2010, том 75, вып. 2, с. 305–312
УДК 577.150.2
Новый структурный мотив и структурные деревья содержащих его белков
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: βαβ-единица, моделирование, ψ-мотив, сворачивание белков, структурная классификация.
Аннотация
В настоящей работе проведен анализ нового структурного мотива, который представляет собой комбинацию двух известных мотивов – ψ-мотива и βαβ-единицы. И тот и другой могут существовать в «правой» и «левой» формах, образуя четыре теоретически возможные комбинации. Собрана база данных из 140 негомологичных белков, содержащих 158 таких комбинаций, большая часть которых (87 комбинаций) сочетала правый ψ-мотив и правую βαβ-единицу. При этом вообще не было найдено комбинаций левого ψ-мотива и левой βαβ-единицы. На основании полученных данных построены три структурных дерева, корневыми структурами в которых являются три реально встречающиеся комбинации.