БИОХИМИЯ, 2010, том 75, вып. 2, с. 264–274
УДК 577.152.3
Антимикробные и другие олигопептиды винограда
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: олигопептид, виноград, предшественник, антимикробный пептид, биоинформатика.
Аннотация
На сегодняшний день известны структуры и функции около 700 олигопептидов различных растений. Однако из винограда выделен и охарактеризован только один олигопептид. В то же время у этого растения выявлены десятки тысяч неохарактеризованных аминокислотных последовательностей, среди которых могут быть и предшественники олигопептидных регуляторов. В связи с научной и практической важностью проблемы врожденного иммунитета сельскохозяйственных растений нами предпринято структурно-функциональное исследование этих последовательностей с целью идентификации новых регуляторных олигопептидов, в том числе и антимикробных агентов. Для этого был разработан специальный метод компьютерного анализа, позволяющий сравнивать первичные структуры возможных предшественников олигопептидов винограда с аминокислотными последовательностями известных олигопептидов других растений. Структурное сходство служило основанием для предсказания потенциальных функциональных свойств. В результате обнаружено более 20 новых структур антимикробных и других олигопептидов винограда.