БИОХИМИЯ, 2009, том 74, вып. 12, с. 1709–1717

УДК 577.218

Новое семейство мобильных элементов генома человека, образованное при захвате первого экзона гена MAST2 ретротранспозоном SVA*,**

© 2009 О.Б. Бантыш, А.А. Буздин ***

Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН

Поступила в редакцию 22.07.2009
После доработки 21.09.2009

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: молекулярная эволюция, ДНК человека, ретроэлементы, мобильные элементы генома, регуляция транскрипции.

Аннотация

Обнаружено новое специфичное для ДНК человека семейство мобильных элементов генома, представители которого содержат в своем составе экзон, объединенный с последовательностью ретротранспозона SVA. Согласно предложенному нами механизму, это семейство, названное CpG-SVA, образовалось благодаря 5′-трансдукции, осуществленной вставкой элемента SVA. После разделения предковых линий человека и шимпанзе ретротранспозон SVA встроился в первый интрон гена MAST2 в прямой ориентации. В результате сплайсинга аберрантной РНК, получившейся с промотора MAST2, но терминально процессированной по сигналу полиаденилирования SVA, первый экзон MAST2 объединился со сплайсированным 3′-концевым фрагментом ретротранспозона. Образовавшийся предковый элемент CpG-SVA в результате ретротранспозиции собственных копий образовал одноименное семейство, представленное в геноме человека 76 членами. Привлечение CpG-островка в состав таких гибридных элементов, по-видимому, оказалось выгодно с точки зрения повышения частоты ретротранспозиции. Кроме того, анализ последовательностей разных копий CpG-SVA в геноме позволил установить, что для обратной транскриптазы L1 человека, участвующей в их ретротранспозиции, характерно нематричное навешивание цитозина на 3′-конец синтезированной первой цепи кДНК.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Ускоренная публикация.

** Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in press, BM09-214, 15.11.2009.

*** Адресат для корреспонденции.