БИОХИМИЯ, 2009, том 74, вып. 11, с. 1539–1547
УДК 577.151.042
Влияние ионов тяжелых металлов на активность ДНК-гликозилаз семейства FPG
1 Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
2 Новосибирский государственный университет
Поступила в редакцию 04.12.2008
После доработки 19.01.2009
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: окислительный стресс, репарация ДНК, ДНК-гликозилазы, тяжелые металлы.
Аннотация
Прокариотические ферменты формамидопиримидин-ДНК-гликозилаза (Fpg) и эндонуклеаза VIII (Nei) семейства Fpg и их эукариотические гомологи NEIL1, NEIL2 и NEIL3 инициируют процесс репарации окисленных оснований ДНК. Известно, что репарация окислительных повреждений ДНК in vivo ингибируется в присутствии ионов некоторых тяжелых металлов. Исследовано влияние солей ряда щелочноземельных и переходных металлов на активность ДНК-гликозилаз семейства Fpg в реакции отщепления остатков 5,6-дигидроурацила – типичного продукта окислительного повреждения ДНК. Установлено, что для реакции, катализируемой ферментом NEIL1, характерны значения Km = 150 нм и kcat = 1,2 мин–1, которые находятся в диапазоне известных значений этих величин для отщепления этим ферментом других поврежденных оснований. Обнаружено, что как белок NEIL1, так и гомологичные ему прокариотические ДНК-гликозилазы Fpg и Nei ингибируются Al3+, Ni2+, Co2+, Cd2+, Cu2+, Zn2+ и Fe2+ в буфере Tris-HCl и Cd2+, Zn2+, Cu2+ и Fe2+ в калий-фосфатном буфере. Значения I50 для ингибирования фермента NEIL1 составили 7 мкМ для Cd2+, 16 мкМ для Zn2+ и 400 мкМ для Cu2+. Ингибирование фермента NEIL1 ионами Cd2+, Zn2+ и Cu2+ было по крайней мере частично обусловлено образованием комплексов металлов с ДНК-субстратом. Присутствие Cd2+ и Cu2+, преимущественно связывающихся с основаниями ДНК, а не с фосфатными группами, приводило к потере способности фермента связывать поврежденную ДНК лучше, чем неповрежденную. Таким образом, ингибирование репарации окислительных повреждений ДНК ферментом NEIL1 ионами тяжелых металлов может служить одной из причин их комутагенных свойств при окислительном стрессе.
Текст статьи
Сноски
* Адресат для корреспонденции.