БИОХИМИЯ, 2009, том 74, вып. 9, с. 1280–1285

УДК 517.15

Моделирование кинетических изотопных эффектов 18O при ферментативном гидролизе гуанозинтрифосфата

© 2009 А.В. Немухин 1,2*, М.С. Шадрина 1, Б.Л. Григоренко 1, С. Ду 3

1 Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова

2 Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН

3 Department of Biochemistry, University of Texas, Southwestern Medical Center

Поступила в редакцию 29.09.2008
После доработки 30.10.2008

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: кинетический изотопный эффект, гидролиз GTP, p21Ras, Ras-GAP, EF-Tu.

Аннотация

Сопоставлены результаты расчетов кинетических изотопных эффектов (КИЭ) для ряда меченных изотопом кислорода 18O субстратов при ферментативном гидролизе гуанозинтрифосфата (GTP), проведенных методом квантовой механики–молекулярной механики (КМ/ММ), с экспериментальными данными. В соответствии с концепцией количественных соотношений структура–активность проанализирована корреляция между КИЭ и структурой субстратов с использованием индекса замещения, который также используется для лучшей визуализации экспериментальных и теоретических данных. Очевидная корреляция между вычисленными и измеренными КИЭ подтверждает преимущественно диссоциативный характер механизма реакции гидролиза GTP, предсказываемый моделированием методом КМ/ММ.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи:

captcha

Сноски

* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.