Молекулярные механизмы связывания имидазольных и бензольных колец в белках

Аннотация

Ароматические связи радикалов аминокислотных остатков играют важную роль в организации пространственной структуры белка. Ранее теоретически и экспериментально было показано существование ряда предпочтительных конформаций ароматических димеров, из которых наиболее известными являются параллельно-смещенная и перпендикулярная Т-конформации. С целью выявления принципов, определяющих предпочтительность различных конформаций для димеров His–His и Phe–His, выполнены неэмпирические квантовохимические расчеты диимидазола и бензол-имидазола. Расчеты проведены с использованием базиса 6-31G**, с учетом электронных корреляций в рамках методов теории возмущения МР2 и МР4. Сравнительный анализ энергетических и геометрических параметров систем указывает на предпочтительность формирования стэкинг-связи либо классической водородной связи в диимидазоле. Для бензол-имидазола, напротив, максимально выгодной является Т-конформация.

Текст статьи

Пожалуйста, введите код, чтобы получить PDF файл с полным текстом статьи: