БИОХИМИЯ, 2009, том 74, вып. 8, с. 1091–1102
УДК 577.322
Предсказание аминокислотных остатков, защищенных от водородно-дейтериевого обмена, в белковой цепи*
Институт белка РАН
Поступила в редакцию 16.02.2009
После доработки 03.03.2009
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: водородно-дейтериевый обмен, вторичная структура, водородная связь, B-фактор, участки с нерегулярной вторичной структурой.
Аннотация
Исследована возможность предсказания защищенности аминокислотных остатков от водородно-дейтериевого обмена. Составлена база данных, состоящая из 14 белков, для которых известны экспериментальные данные по водородно-дейтериевому обмену. Проведен анализ различных структурных параметров, связанных с подвижностью аминокислотных остатков и их амидных групп, на предмет выяснения, могут ли эти параметры быть использованы для предсказания защищенности аминокислотных остатков от водородно-дейтериевого обмена. Разработан метод предсказания аминокислотных остатков, защищенных от водородно-дейтериевого обмена, исходя из аминокислотной последовательности белка.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in press, BM09-044, 28.06.2009.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.