БИОХИМИЯ, 2009, том 74, вып. 8, с. 1074–1083
УДК 577.123
Изучение функциональной роли метилирования в локусе FXYD5–COX7A1 19 хромосомы человека*
Институт Биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Поступила в редакцию 30.01.2009
После доработки 18.02.2009
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: профиль метилирования, регуляция экспрессии генов, MAG, HAMP.
Аннотация
Использована методика Rapid Identification of Genomic Splits для получения подробного профиля метилирования полигенного локуса FXYD5–COX7A 19 хромосомы человека для нормальной и опухолевой тканей легкого, а также клеточной линии A549 (карцинома легкого). Все три образца характеризовались кластеризацией неметилированных сайтов, при этом распределение гипометилированных участков не коррелировало с положением генов в локусе. Профиль метилирования этого протяженного геномного локуса достаточно стабилен и практически не изменен в опухолевой легочной ткани по сравнению с нормальной тканью. С другой стороны, профиль метилирования локуса FXYD5–COX7A у клеточной линии A549 существенно отличается от тканей на участке USF2–MAG. При сравнительном анализе транскрипционной активности генов, находящихся в этом районе, прямая корреляция между метилированием и экспрессией не обнаружена, хотя имеются некоторые данные о возможной роли метилирования в регуляции экспрессии гена MAG посредством цис-регуляторных элементов. В целом, наши данные являются новым доказательством необходимости пересмотра взглядов, превалирующих в настоящее время, на функциональное значение метилирования в геноме.
Текст статьи
Сноски
* Первоначально английский вариант рукописи был опубликован на сайте «Biochemistry» (Moscow), Papers in Press, BM09-030, 21.06.2009.
** Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.