Ингибирование жирными кислотами взаимодействия ДНК и β-полимеразы

1 Key Laboratory of Biorheological Science and Technology (Chongqing University), Ministry of Education; Bioengineering College, Chongqing University

2 Department of Information Engineering, Chongqing Communication College

3 Southwest Eye Hospital, Southwest Hospital, Third Military Medical University

4 Харьковский национальный университет радиоэлектроники

Поступила в редакцию 06.10.2008
После доработки 24.11.2008

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: ДНК-полимераза β, поверхностный плазмонный резонанс, жирные кислоты, ингибирование, ППР-биосенсор.

Аннотация

Изучено связывание ДНК-полимеразы β человека с дуплексом матричная цепь ДНК–праймер и одноцепочечной ДНК в отсутствие или в присутствии ингибиторов полимеразы. Исследования проведены с помощью биосенсора для поверхностного плазмонного резонанса. Две жирные кислоты, линолевую и ацетэруковую, использовали как сильные ингибиторы β-полимеразы. Обнаружено, что при взаимодействии β-полимеразы и ДНК полимераза β могла связывать одноцепочечную ДНК в одиночном режиме, но связывалась с дуплексами матричная ДНК–праймер в параллельном режиме. Установлено, что оба ингибитора β-полимеразы препятствовали ее связыванию с выступающим одноцепочечным концом и изменяли характер связывания с параллельного на одиночный. Отмечено, что сродство β-полимеразы к участку дуплекса матричная цепь–праймер в присутствии ацетэруковой или линолевой кислоты уменьшалось соответственно в 20 и 5 раз. Определено, что значительное ингибирующее влияние ацетэруковой кислоты на взаимодействие ДНК-полимеразы β с дуплексом вызвано как двукратным уменьшением скорости ассоциации, так и девятикратным увеличением скорости диссоциации. В присутствии линолевой кислоты не наблюдалось существенных изменений в скорости ассоциации и уменьшение сродства β-полимеразы к ДНК в основном было вызвано семикратным увеличением скорости диссоциации.

Текст статьи

Сноски

* Адресат для корреспонденции и запросов оттисков.