БИОХИМИЯ, 2009, том 74, вып. 2, с. 247–256
УДК 577.152.3
Гемоглобин как потенциальный источник природных регуляторных олигопептидов
1 Институт биохимии им. А.Н. Баха РАН
2 Universidad Tecnica Federico Santa Maria, Departamento de Informatica
Поступила в редакцию 29.01.2008
После доработки 20.03.2008
КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: гемоглобин, фрагмент, нейропептид, гормон, антимикробный олигопептид, база данных EROP-Moscow, континуум.
Аннотация
Проведен теоретический структурно-функциональный анализ всех возможных фрагментов молекулы гемоглобина с целью определения участков, которые могли бы быть потенциальными источниками регуляторных олигопептидов. Для этого использованы известные данные о первичной структуре гемоглобина быка, информация базы данных EROP-Moscow о структуре и функциях природных олигопептидов, а также компьютерный программный комплекс. Обнаружено 6750 природных негемоглобиновых олигопептидов с фрагментами гемоглобина, содержащими 2–14 аминокислотных остатков. Структуры 20 из них оказались полностью идентичными фрагментам гемоглобина. Установлено, что большинство выявленных олигопептидов обладают свойствами нейропептидов, антимикробных агентов и гормонов. Ряд из них обладает функциями, которые не были ранее известны для фрагментов гемоглобина. Обсуждена возможность естественного образования регуляторных олигопептидов из молекул гемоглобина и других пищевых белков, образование пула экзогенных олигопептидов, их участие в процессах регуляции, а также соответствие полученных результатов представлениям об олигопептидном континууме.